Topológia sietí proteín-proteínových interakcií
Analýza sietí proteín-proteínových interakcií (PPI) identifikuje a charakterizuje štrukturálne vlastnosti bunkových sietí interakcií. Tento prístup, ktorý iniciovali Uetz a kolektív prostredníctvom rozsiahleho skríningu metódou kvasinkového dvojitého hybridu (yeast two-hybrid), odhaľuje topologické vlastnosti, ako sú centrá (hubs), moduly a motívy, ktoré kódujú funkčnú organizáciu a asociácie s chorobami.
Prečítať celú metódu
Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.
Mapa metód
Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.
Zdroje
- Uetz, P., Giot, L., Cagney, G., Mansfield, T. A., Judson, R. S., Knight, J. R., ... & Lomax, J. (2000). A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae. Nature, 403(6770), 623-627. DOI: 10.1038/35001009 ↗
- Barabási, A. L. & Oltvai, Z. N. (2004). Network biology: understanding the cell's functional organization. Nature Reviews Genetics, 5(2), 101-113. DOI: 10.1038/nrg1272 ↗
- Szklarczyk, D., Gable, A. L., Lyon, D., Junge, A., Wyder, S., Huerta-Cepas, J., ... & Mering, C. V. (2021). STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets. Nucleic Acids Research, 49(D1), D605-D612. link ↗
Ako citovať túto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Protein-Protein Interaction Network Analysis and Topology. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/ppi-network-topology
Ktorá metóda?
Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.
- Rekonštrukcia pomocou kryo-EMBioinformatika↔ porovnať
- Vyhľadávanie pomocou HMMER profilovBioinformatika↔ porovnať
- Molekulárne dokovanieBioinformatika↔ porovnať
Odkazujú sem
Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →