Analýza diferenciálnych zmien počtu kópií — Komparatívna analýza CNV / SCNA
Analýza diferenciálnych zmien počtu kópií (dCNV) identifikuje genómové regióny, kde sa počty kópií DNA systematicky líšia medzi dvoma podmienkami — napríklad medzi nádorovou a normálnou tkaninou, prípadmi a kontrolnými kohortami alebo liečenými a neliečenými bunkami. Kombináciou štatistickej segmentácie a testovania na úrovni skupín, ktoré využíva údaje o hĺbke čítania na úrovni sond alebo intenzite z polí, lokalizuje somatické amplifikácie a delécie, ktoré môžu byť hnacou silou ochorenia, a rozlišuje medzi opakujúcimi sa hnacími udalosťami a šumom pasažierov v rámci kohorty.
Prečítať celú metódu
Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.
Mapa metód
Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.
Zdroje
- Olshen, A. B., Venkatraman, E. S., Lucito, R., & Wigler, M. (2004). Circular binary segmentation for the analysis of array-based DNA copy number data. Biostatistics, 5(4), 557–572. DOI: 10.1093/biostatistics/kxh008 ↗
- Mermel, C. H., Schumacher, S. E., Hill, B., Meyerson, M. L., Beroukhim, R., & Getz, G. (2011). GISTIC2.0 facilitates sensitive and confident localization of the targets of focal somatic copy-number alteration in human cancers. Genome Biology, 12(4), R41. DOI: 10.1186/gb-2011-12-4-r41 ↗
Ako citovať túto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Differential Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/differential-copy-number-variation-analysis
Ktorá metóda?
Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.
- Genómová asociačná štúdia (GWAS)Bioinformatika↔ porovnať
Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →