Analiza variației numărului de copii bazată pe rețea
Analiza variației numărului de copii (CNV) bazată pe rețea integrează datele CNV la nivel de genom cu rețelele de interacțiune biologică — cum ar fi interacțiunea proteină-proteină (PPI) sau rețelele de căi de semnalizare — pentru a identifica regiuni funcțional coerente, gene driver și subrețele alterate pe care detectarea brută a CNV-urilor le-ar omite. Prin propagarea semnalelor CNV prin graful rețelei, metoda relevă dezechilibre de dozaj genomic coordonate care converg către funcții biologice comune, fiind deosebit de puternică în genomica cancerului și în studiile bolilor rare.
Citește metoda completă
Autentifică-te cu un cont gratuit pentru a citi această secțiune.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Surse
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
Cum se citează această pagină
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ro/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analiza variației numărului de copiiBioinformatică↔ compare
- Analiza de îmbogățire a seturilor de gene (GSEA)Bioinformatică↔ compare
- GWAS bazat pe rețeleBioinformatică↔ compare
- Analiza diferențială a expresiei RNA-seq bazată pe rețeaBioinformatică↔ compare
- Analiza de îmbogățire a căilor metaboliceBioinformatică↔ compare
- Variant CallingBioinformatică↔ compare
Ai observat o problemă pe această pagină? Raportează sau sugerează o corectură →