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Single-cell Phylogenetic Analysis/Evidência
Registro de evidência do método

Single-cell Phylogenetic Analysis

Single-cell phylogenetic analysis reconstructs evolutionary or developmental trees from single-cell sequencing data, tracing how individual cells diverged from a common ancestor. By leveraging somatic mutations, CRISPR-introduced barcodes, or copy-number changes as heritable characters, this method maps clonal relationships within tumors, developing tissues, or immune repertoires with unprecedented cellular resolution.

Sources recorded, not reviewed

Registro de origem

Citações copiadas literalmente do registro de origem do método. Nenhuma verificação em nível de alegação é inferida delas.

Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction
Registro de método taxonômico · process-pipeline / bioinformatics
  • Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. · DOI 10.1186/s13059-020-02000-8
  • Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. · DOI 10.1038/nbt.2859
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Alegações curadas

Alegações persistidas no livro-razão de evidências, cada uma com sua própria avaliação.

Ainda não há alegações curadas

Esta visualização não inventa uma avaliação de alegação quando o livro-razão não a possui.

Métodos relacionados

Gerado a partir do grafo de métodos e mostrado como relações sugeridas por máquina — nenhuma alegação de evidência é inferida.

Taxonomic bucketCopy Number Variation Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketPhylogenetic Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell RNA-seq analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketVariant Callingmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

Status da evidência

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

Fontes

2 citações registradas, copiadas do registro de origem do método.

Ações

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