Alinhamento de Sequências de Célula Única — Mapeamento de Leituras de scRNA-seq
O alinhamento de sequências de célula única é a etapa computacional que mapeia milhões de leituras curtas de sequenciamento produzidas por experimentos de RNA-seq de célula única de volta a um genoma ou transcriptoma de referência. Diferentemente do alinhamento de RNA-seq em massa, cada leitura carrega um código de barras celular e um Identificador Molecular Único (UMI) que, juntos, identificam a célula de origem e a molécula de RNA individual. O alinhamento preciso e a desmultiplexação de códigos de barras são pré-requisitos para a construção da matriz de contagem célula-por-gene que impulsiona todas as análises de célula única subsequentes.
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Fontes
- Dobin, A., Davis, C. A., Schlesinger, F., Drenkow, J., Zaleski, C., Jha, S., Batut, P., Chaisson, M., & Gingeras, T. R. (2013). STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner. Bioinformatics, 29(1), 15–21. DOI: 10.1093/bioinformatics/bts635 ↗
- Smith, T., Heger, A., & Sudbery, I. (2017). UMI-tools: modeling sequencing errors in Unique Molecular Identifiers to improve quantification accuracy. Genome Research, 27(3), 491–499. DOI: 10.1101/gr.209601.116 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA-seq Sequence Alignment. ScholarGate. https://scholargate.app/pt/bioinformatics/single-cell-sequence-alignment
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- Análise de Expressão Diferencial de RNA-seqBioinformática↔ compare
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