Analiza filogenetyczna pojedynczych komórek — rekonstrukcja drzewa rodowego w rozdzielczości pojedynczej komórki
Analiza filogenetyczna pojedynczych komórek rekonstruuje drzewa ewolucyjne lub rozwojowe na podstawie danych sekwencjonowania pojedynczych komórek, śledząc, w jaki sposób poszczególne komórki zróżnicowały się od wspólnego przodka. Wykorzystując mutacje somatyczne, kody kreskowe wprowadzone za pomocą CRISPR lub zmiany liczby kopii jako dziedziczne cechy, metoda ta mapuje relacje klonalne w guzach, rozwijających się tkankach lub repertuarach immunologicznych z niespotykaną dotąd rozdzielczością komórkową.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Źródła
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analiza zmienności liczby kopiiBioinformatyka↔ compare
- Analiza filogenetycznaBioinformatyka↔ compare
- Analiza scRNA-seq pojedynczych komórekBioinformatyka↔ compare
- WariantyBioinformatyka↔ compare
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →