Bayesiansk fylogenetisk analyse — MCMC-basert inferens av evolusjonære trær
Bayesiansk fylogenetisk analyse bruker Bayes' teorem og Markov chain Monte Carlo (MCMC) sampling for å estimere den posteriore sannsynlighetsfordelingen over fylogenetiske trær og modellparametre gitt observerte sekvensdata. I motsetning til bootstrapped maksimum-likelihood-metoder som returnerer ett enkelt beste tre, gir Bayesiansk inferens et troverdig sett av trær med tilhørende posteriore sannsynligheter, noe som gir et prinsipiell mål på fylogenetisk usikkerhet. Det er det dominerende rammeverket for estimering av divergensdatoer og ancestrale relasjoner i molekylær evolusjon.
Les hele metoden
Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Kilder
- Ronquist, F., & Huelsenbeck, J. P. (2003). MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models. Bioinformatics, 19(12), 1572–1574. DOI: 10.1093/bioinformatics/btg180 ↗
- Drummond, A. J., & Rambaut, A. (2007). BEAST: Bayesian evolutionary analysis by sampling trees. BMC Evolutionary Biology, 7(1), 214. DOI: 10.1186/1471-2148-7-214 ↗
Slik siterer du denne siden
ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Phylogenetic Analysis using Markov Chain Monte Carlo. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/bayesian-phylogenetic-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Bayesiansk GWASBioinformatikk↔ compare
- Fylogenetisk analyseBioinformatikk↔ compare
- SekvensjusteringBioinformatikk↔ compare
Referert av
Funnet en feil på denne siden? Rapporter eller foreslå en rettelse →