CRISPR-screenanalyse
CRISPR-screenanalyse verwerkt data van gepoolde genetische screenings met CRISPR-Cas9 om genen te identificeren die vereist zijn voor celgroei, overleving of fenotype onder specifieke omstandigheden. Deze computationele pijplijn, ontwikkeld door Zhang, Sanjana en anderen, transformeert sequentie-uitvoer van gids-RNA-abundanties in gerangschikte lijsten van functionele genen.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Bronnen
- Shalem, O., Sanjana, N. E., Hartenian, E., Shi, X., Scott, D. A., Mikkelsen, T. S., ... & Zhang, F. (2014). Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Science, 343(6166), 84-87. DOI: 10.1126/science.1247005 ↗
- Hart, T., Chandrashekhar, M., Aregger, M., Steinhart, Z., Brown, K. R., MacLeod, G., ... & Moffat, J. (2015). High-resolution CRISPR screens reveal fitness genes and pathways. Molecular Systems Biology, 11(8), 820. link ↗
- King, J. B., Palmer, A. C., & Sorger, P. K. (2020). Application of a genetic algorithm designed for flexible objective optimization in pharmaceutical research and development. Cancer Research, 79(13 Supplement), 3435. link ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). CRISPR Screening Data Analysis and Hit Identification. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/crispr-screen-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- De Novo Transcriptome AssemblyBio-informatica↔ compare
- HMMER Profiel ZoekopdrachtBio-informatica↔ compare
- Metagenoom BinningBio-informatica↔ compare
Geciteerd door
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →