Rhizosfeeranalyse met ampliconsequencing — Profilering van het wortelzone-microbioom
Rhizosphere Amplicon Analysis is een moleculair-ecologische pijplijn die wordt gebruikt om de microbiele gemeenschappen te karakteriseren die de wortel-aangrenzende bodemzone — de rhizosfeer — bewonen, door gerichte markergenen te sequencen, zoals het bacteriële 16S rRNA-gen of de schimmel ITS-regio. Het wordt veel toegepast in de agronomie, bodemecologie en plantpathologie en stelt onderzoekers in staat te identificeren welke micro-organismen aanwezig zijn, hoe hun samenstelling verschuift onder verschillende gewassen, behandelingen of bodemomstandigheden, en hoe de gemeenschapsstructuur zich verhoudt tot plantgezondheid en productiviteit.
Lees de volledige methode
Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.
Bronnen
- Lundberg, D. S., Lebeis, S. L., Paredes, S. H., Yourstone, S., Gehring, J., Malfatti, S., ... & Dangl, J. L. (2012). Defining the core Arabidopsis thaliana root microbiome. Nature, 488(7409), 86-90. DOI: 10.1038/nature11237 ↗
- Berendsen, R. L., Pieterse, C. M., & Bakker, P. A. (2012). The rhizosphere microbiome and plant health. Trends in Plant Science, 17(8), 478-486. DOI: 10.1016/j.tplants.2012.04.001 ↗
Deze pagina citeren
ScholarGate. (2026, June 3). Rhizosphere Amplicon Sequencing and Community Profiling. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/agronomy/rhizosphere-amplicon-analysis
Similar methods
Een fout op deze pagina gezien? Meld het of stel een correctie voor →