Analīze ar amplifikācijas marķieriem rizofērā — mikrobioma profilēšana sakņu zonā
Analīze ar amplifikācijas marķieriem rizofērā ir molekulāri ekoloģiska pipeline, ko izmanto, lai raksturotu mikrobu kopienas, kas apdzīvo sakņu tuvumā esošo augsnes zonu — rizofēru — sekvenējot noteiktus marķiergēnus, piemēram, baktēriju 16S rRNA gēnu vai sēņu ITS reģionu. Plaši izmantota agronomijā, augsnes ekoloģijā un augu patoloģijā, tā ļauj pētniekiem identificēt, kādi mikroorganismi ir klātesoši, kā to sastāvs mainās dažādu kultūraugu, apstrāžu vai augsnes apstākļu ietekmē, un kā kopienas struktūra ir saistīta ar augu veselību un produktivitāti.
Lasīt pilno metodes aprakstu
Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.
Avoti
- Lundberg, D. S., Lebeis, S. L., Paredes, S. H., Yourstone, S., Gehring, J., Malfatti, S., ... & Dangl, J. L. (2012). Defining the core Arabidopsis thaliana root microbiome. Nature, 488(7409), 86-90. DOI: 10.1038/nature11237 ↗
- Berendsen, R. L., Pieterse, C. M., & Bakker, P. A. (2012). The rhizosphere microbiome and plant health. Trends in Plant Science, 17(8), 478-486. DOI: 10.1016/j.tplants.2012.04.001 ↗
Kā citēt šo lapu
ScholarGate. (2026, June 3). Rhizosphere Amplicon Sequencing and Community Profiling. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/agronomy/rhizosphere-amplicon-analysis
Similar methods
Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →