방법 증거 기록
Network-based pathway enrichment analysis
Network-based pathway enrichment analysis integrates molecular interaction networks — protein-protein interactions, signalling graphs, or gene regulatory networks — with omics measurements to identify biological pathways that are coordinately altered in a condition. Unlike classical over-representation or gene-set enrichment approaches that treat pathway genes as independent lists, this family of methods propagates signals across network edges, capturing the topology of interactions and uncovering dysregulated modules that flat-list enrichment would miss.
원본 기록
방법의 원본 기록에서 그대로 복사된 인용입니다. 이로부터 수준별 검증이 추론되지 않습니다.
Network-based Pathway Enrichment Analysis
분류학적 방법 기록 · process-pipeline / bioinformatics
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. · URL
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. · DOI 10.1093/bioinformatics/btq182
큐레이션된 주장
각각 자체 평가와 함께 증거 원장에 유지된 주장입니다.
아직 큐레이션된 주장이 없습니다
원장에 주장 평가가 없는 경우 이 보기에서는 주장 평가를 만들지 않습니다.
관련 방법
방법 그래프에서 생성되었으며 기계가 제안한 관계로 표시됩니다 — 증거 주장이 추론되지 않습니다.