Process / pipelineBioinformatics / omics
단일 세포 서열 정렬 — scRNA-seq 리드 매핑
단일 세포 서열 정렬은 단일 세포 RNA-seq 실험에서 생성된 수백만 개의 짧은 서열 리드를 참조 유전체 또는 전사체에 다시 매핑하는 계산 단계입니다. 벌크 RNA-seq 정렬과 달리 각 리드는 세포 바코드와 고유 분자 식별자(UMI)를 포함하며, 이 둘은 함께 원래 세포와 개별 RNA 분자를 식별합니다. 정확한 정렬 및 바코드 디멀티플렉싱은 모든 다운스트림 단일 세포 분석을 구동하는 세포-유전자 수 행렬을 구성하기 위한 전제 조건입니다.
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출처
- Dobin, A., Davis, C. A., Schlesinger, F., Drenkow, J., Zaleski, C., Jha, S., Batut, P., Chaisson, M., & Gingeras, T. R. (2013). STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner. Bioinformatics, 29(1), 15–21. DOI: 10.1093/bioinformatics/bts635 ↗
- Smith, T., Heger, A., & Sudbery, I. (2017). UMI-tools: modeling sequencing errors in Unique Molecular Identifiers to improve quantification accuracy. Genome Research, 27(3), 491–499. DOI: 10.1101/gr.209601.116 ↗
이 페이지 인용 방법
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA-seq Sequence Alignment. ScholarGate. https://scholargate.app/ko/bioinformatics/single-cell-sequence-alignment
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