Process / pipelineSingle-cell genomics
RNA Velocity（RNA速度）
RNA velocityは、単一細胞RNAシーケンシングデータから個々の細胞の将来的な発生状態を推定する計算手法である。2018年にLa Mannoらによって開発されたRNA velocity解析は、個々の細胞内の未スプライシングmRNA転写産物とスプライシング済みmRNA転写産物の比率を解析することにより、細胞状態遷移の方向と速度を測定する。これにより、時間的サンプリングや操作を必要とせずに細胞軌道や分化経路を予測することが可能となり、発生や疾患における細胞運命決定に関する独自の洞察を提供する。
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出典
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/genetics/rna-velocity
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