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ATAC-seq Analysis/証拠
手法証拠記録

ATAC-seq Analysis

ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) is a method for profiling the landscape of chromatin accessibility genome-wide. Developed by Buenrostro and colleagues in 2013, ATAC-seq uses hyperactive transposase to tag open, accessible chromatin regions, enabling rapid and sensitive identification of regulatory DNA elements. ATAC-seq has become a standard technique for characterizing gene regulatory landscapes, discovering cell-type-specific regulatory elements, and inferring gene regulatory networks.

Sources recorded, not reviewed

出典記録

引用は手法の出典記録からそのままコピーされています。それらからレベルごとの検証は推論されません。

ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes
分類的手法記録 · process-pipeline / genetics
  • Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. · URL
  • Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. · DOI 10.1038/ng.3646
  • Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. · URL
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キュレーションされた主張

主張は証拠台帳に永続化され、それぞれが独自の評価を持っています。

まだキュレーションされた主張はありません

このビューは、台帳に主張評価がない場合、主張評価を生成しません。

関連手法

手法グラフから生成され、機械が提案した関係として表示されます — 証拠主張は推論されません。

Same method familyHi-C Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Same method familyRNA Velocitymachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

証拠ステータス

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

出典

手法の出典記録からコピーされた、記録された引用3件。

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