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時系列 eQTL 解析 — 遺伝子発現の動的遺伝子制御

時系列 eQTL 解析は、遺伝子発現に対する効果が時間とともに、あるいは発達段階を通じて変化する遺伝子変異(eQTL)を同定する。縦断的なRNA-seqデータと個々の遺伝子型を組み合わせることで、同じSNPが異なる時点での遺伝子調節を活性化、抑制、あるいは再形成する様子を捉え、分化、疾患進行、環境応答などのプロセスにおけるゲノムの調節プログラムの時間的構造を明らかにする。

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出典

  1. Fair, B. J., et al. (2020). Gene expression variability in human and chimpanzee populations share common determinants. eLife, 9, e59929. link
  2. Strober, B. J., et al. (2019). Dynamic genetic regulation of gene expression during cellular differentiation. Science, 364(6447), 1287–1290. link

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ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Expression Quantitative Trait Loci Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/time-series-eqtl-analysis

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ScholarGateTime-series eQTL analysis (Time-series Expression Quantitative Trait Loci Analysis). 2026-06-15に以下より取得 https://scholargate.app/ja/bioinformatics/time-series-eqtl-analysis · データセット: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026