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差次的コピー数変異解析 — 比較CNV / SCNA解析
差次的コピー数変異(dCNV)解析は、腫瘍対正常組織、症例対対照コホート、または治療済み対未治療細胞などの2つの条件間でDNAコピー数が系統的に異なるゲノム領域を同定します。プローブレベルのリードデプスまたはアレイ強度データと統計的セグメンテーションおよび群レベルの検定を組み合わせることで、疾患を駆動する可能性のある体細胞増幅および欠失を特定し、コホート全体で再発性のドライバーイベントとパッセンジャーノイズを区別します。
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出典
- Olshen, A. B., Venkatraman, E. S., Lucito, R., & Wigler, M. (2004). Circular binary segmentation for the analysis of array-based DNA copy number data. Biostatistics, 5(4), 557–572. DOI: 10.1093/biostatistics/kxh008 ↗
- Mermel, C. H., Schumacher, S. E., Hill, B., Meyerson, M. L., Beroukhim, R., & Getz, G. (2011). GISTIC2.0 facilitates sensitive and confident localization of the targets of focal somatic copy-number alteration in human cancers. Genome Biology, 12(4), R41. DOI: 10.1186/gb-2011-12-4-r41 ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Differential Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/differential-copy-number-variation-analysis
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