Pemanggilan Puncak ChIP-seq Bayesian — Deteksi Pengayaan Probabilistik dalam Data Epigenomik

Pemanggilan puncak ChIP-seq Bayesian menerapkan model probabilistik — biasanya Poisson, binomial negatif, atau model Markov tersembunyi dengan inferensi Bayesian — untuk mendeteksi wilayah genomik yang diperkaya untuk protein yang diminati dalam eksperimen imunopresipitasi kromatin diikuti dengan pengurutan. Dengan secara eksplisit memodelkan kebisingan hitungan baca dan memasukkan distribusi prior, pemanggil Bayesian menghasilkan probabilitas posterior pengayaan daripada nilai-p sederhana, menyediakan kerangka kerja yang berprinsip untuk kuantifikasi ketidakpastian di seluruh genom.