ScholarGate
Asszisztens
Process / pipelineBioinformatics / omics

Idősoros variánshívás — Longitudinal szomatikus mutációdetektálás

Az idősoros variánshívás egy bioinformatikai pipeline, amely azonosítja és nyomon követi a genomvariánsokat — tipikusan szomatikus mutációkat — egyazon alanytól különböző időpontokban gyűjtött több szekvenálási mintán keresztül. Legszélesebb körben a rákk<bos>genomikában alkalmazzák a daganat evolúciójának rekonstruálására, a minimális reziduális betegség monitorozására és a terápiarezisztens klónok megjelenésének kimutatására. A variáns allélfrekvenciák időbeli dimenzió mentén történő együttes modellezésével a módszer megkülönbözteti az igazi szomatikus változásokat a szekvenálási zajtól, és becsli a klonális dinamikát az idő múlásával.

Megnyitás itt: MethodMindHamarosanVideóHamarosanDiák letöltése

A teljes módszer elolvasása

Csak tagoknak

Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.

Bejelentkezés

Módszertérkép

A rokon módszerek környezete — válasszon ki egy csomópontot a felfedezéshez.

Idősoros variánshívás
RNA-seq differenciális e…

Források

  1. Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. link
  2. McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. link

Hogyan hivatkozzon erre az oldalra

ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/bioinformatics/time-series-variant-calling

Melyik módszer?

Állítsa e módszert a hozzá legközelebb álló rokonai mellé, és olvassa őket egymás mellett — a könyvtár az asztalra teszi a könyveket; a választás az Öné.

Összehasonlítás egymás mellett
ScholarGateTime-series variant calling (Time-series Variant Calling). Letöltve 2026-06-15, forrás: https://scholargate.app/hu/bioinformatics/time-series-variant-calling · Adatkészlet: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026