HKA test
Hudson-Kreitman-Aguade (HKA) test je statistička metoda koja ispituje neutralnu evoluciju uspoređujući razine polimorfizma unutar populacije i divergencije između populacija na više lokusa. Razvijen od strane Hudsona, Kreitmana i Aguadea 1987. godine, ovaj test koristi princip da neutralni lokusi trebaju pokazivati očekivane odnose između polimorfizma i divergencije. Lokusi koji odstupaju od ovih odnosa kandidati su za selekciju. HKA test je posebno koristan za detekciju selekcije u genomskim istraživanjima jer koristi relativne usporedbe među lokusima, umjesto da zahtijeva vanjsku kalibraciju.
Pročitajte cijelu metodu
Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Izvori
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/genetics/hka-test
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Koalescentna teorijaGenetika↔ compare
- F-statistike (FST)Genetika↔ compare
- McDonald-Kreitmanov testGenetika↔ compare
- Sweep selekcije (Tajima's D)Genetika↔ compare
Citirana u
Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →