Environmental DNA Metabarcoding
Organizmi stalno ispuštaju DNK (putem izmeta, sluzi, kože, raspadanja) u svoje okruženje. Filtriranjem vode, tla ili sedimenta i sekvenciranjem prisutne miješane DNK, detektiraju se sve vrste koje su obitavale na području uzorkovanja. Na primjer, eDNK u uzorku vode detektira ribe, vodozemce i beskralježnjake bez narušavanja staništa. Metabarcoding pojačava standardiziranu gensku regiju (bar kod) koristeći univerzalne primere, a zatim sekvencira milijune fragmenata DNK. Čitanja se grupiraju u operativne taksonomske jedinice (OTU) ili varijante sekvence pojačivača (ASV) i podudaraju s referentnim bazama podataka radi identifikacije vrsta.
Pročitajte cijelu metodu
Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Izvori
- Taberlet, P., Coissac, E., Hajibabaei, M., & Rieseberg, L. H. (2012). Environmental DNA. Molecular Ecology, 21(8), 1789-1793. DOI: 10.1111/j.1365-294X.2012.05542.x ↗
- Deakin, G., Pettitt-Wade, H., & Waldick, R. C. (2016). Environmental DNA metabarcoding: A review of the application to fish biodiversity assessment in temperate freshwaters. Environmental DNA, 1(1), 4-14. link ↗
- Ficetola, G. F., Miaud, C., Pompanon, F., & Taberlet, P. (2008). Species detection using environmental DNA from water samples. Biology Letters, 4(4), 423-425. DOI: 10.1098/rsbl.2008.0118 ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Environmental DNA Metabarcoding. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/ecology/edna-metabarcoding
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Model bioakumulacijeEkologija↔ compare
- Usmjereno uzorkovanje (Distance Sampling)Ekologija↔ compare
- Funkcijska raznolikostEkologija↔ compare
- Krivulja akumulacije vrstaEkologija↔ compare
Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →