Process / pipelineBioinformatics / omics

Vremensko pozivanje varijanti — longitudinalna detekcija somatskih mutacija

Vremensko pozivanje varijanti (time-series variant calling) je bioinformatički postupak koji identificira i prati genomske varijante — tipično somatske mutacije — u više uzoraka sekvenciranja prikupljenih od istog ispitanika u različitim vremenskim točkama. Najčešće se primjenjuje u tumorskoj genomici za rekonstrukciju tumorske evolucije, praćenje minimalne rezidualne bolesti i detekciju pojave klonova otpornih na terapiju. Zajedničkim modeliranjem frekvencija alela varijanti u vremenskoj dimenziji, metoda razlikuje stvarne somatske promjene od šuma sekvenciranja i procjenjuje klonsku dinamiku tijekom vremena.

Otvorite u MethodMindUskoroVideoUskoroPreuzmi prezentaciju

Pročitajte cijelu metodu

Samo za članove

Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.

Prijavite se

Karta metoda

Okruženje srodnih metoda — odaberite čvor za istraživanje.

Vremensko pozivanje varijanti

RNA-seq diferencijalna e…

Izvori

Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. link ↗
McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. link ↗

Kako citirati ovu stranicu

ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/bioinformatics/time-series-variant-calling

Koja metoda?

Postavite ovu metodu uz njoj najsrodnije i pročitajte ih jednu uz drugu — knjižnica vam knjige stavlja na stol; izbor je na vama.

RNA-seq diferencijalna ekspresijaBioinformatika↔ usporedi

Usporedi jedno uz drugo →

Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →