Jednoćelijsko pozivanje varijanti — otkrivanje mutacija na ćelijskoj rezoluciji
Jednoćelijsko pozivanje varijanti (engl. single-cell variant calling) je bioinformatički postupak koji identificira varijante u slijedu DNK — varijante na jednom nukleotidu (SNV), male insercije i delecije te promjene broja kopija — unutar pojedinačnih stanica umjesto unutar smjese tkiva u rasutom stanju. Rezolucijom mutacijskog krajolika stanicu po stanicu, otkriva unutar-tumorsku heterogenost, klonsku arhitekturu i obrasce somatskih mutacija koje sekvenciranje u rasutom stanju prikriva. Pristup je ključan za genomiku raka, razvojnu biologiju i bilo koju studiju gdje je genetička raznolikost od stanice do stanice primarno pitanje.
Pročitajte cijelu metodu
Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Izvori
- Zafar, H., Wang, Y., Nakhleh, L., Navin, N., & Chen, K. (2016). Monovar: single-nucleotide variant detection in single cells. Nature Methods, 13(6), 505–507. DOI: 10.1038/nmeth.3835 ↗
- Singer, J., Ruscheweyh, H. J., Doherr, M. G., Stadler, T., & Althaus, C. L. (2021). Single-nucleotide variant calling in single-cell sequencing data with piccolo. BMC Bioinformatics, 22(1), 333. link ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/bioinformatics/single-cell-variant-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analiza varijacija broja kopijaBioinformatika↔ compare
Citirana u
Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →