सिस्टमैटिक्स के लिए आणविक मार्कर

विभिन्न आणविक मार्कर अलग-अलग दरों पर विकसित होते हैं, इसलिए किसी दिए गए वर्गीकरण और लौकिक पैमाने पर संबंधों को सुलझाने के लिए सही मार्कर का चुनाव महत्वपूर्ण है।

Definition

एक आणविक मार्कर न्यूक्लिक एसिड या प्रोटीन का एक परिभाषित क्षेत्र है जिसकी टैक्सोन के बीच भिन्नता का उपयोग संबंधों का अनुमान लगाने, जीवों की पहचान करने या प्रजातियों को सीमांकित करने के लिए वर्ण डेटा के रूप में किया जाता है।

Scope

यह विषय सिस्टमैटिक्स में उपयोग किए जाने वाले आणविक मार्करों की श्रेणियों को शामिल करता है, जिसमें राइबोसोमल आरएनए जीन, माइटोकॉन्ड्रियल और क्लोरोप्लास्ट लोकी, परमाणु प्रोटीन-कोडिंग जीन और जीनोम-स्केल डेटा शामिल हैं, साथ ही मार्कर विकासवादी दर को पूछे जा रहे प्रश्न की गहराई से मिलाने के मानदंड भी शामिल हैं।

Core questions

• सिस्टमैटिक्स के लिए किस प्रकार के आणविक मार्कर उपलब्ध हैं?
• मार्कर विकासवादी दर एक फाइलोजेनेटिक प्रश्न की गहराई से कैसे मेल खाती है?
• कुछ मार्कर गहरी बनाम उथली भिन्नताओं के लिए बेहतर क्यों होते हैं?
• फाइलोजेनोमिक्स ने मार्कर के चुनाव को कैसे बदला है?

Key theories

समय-सीमा से दर का मिलान

धीरे-धीरे विकसित होने वाले मार्कर जैसे राइबोसोमल आरएनए जीन प्राचीन भिन्नताओं को सुलझाते हैं, जबकि तेजी से विकसित होने वाले मार्कर हाल के विभाजनों को सुलझाते हैं; बेमेल मार्कर या तो संतृप्त हो जाते हैं या उनमें संकेत की कमी होती है।

एक सार्वभौमिक मार्कर के रूप में राइबोसोमल आरएनए

संरक्षित राइबोसोमल आरएनए जीन ने सभी कोशिकीय जीवन को संबंधित करने के लिए पहला सार्वभौमिक रूप से तुलनीय मार्कर प्रदान किया, जिससे तीन डोमेन की पहचान संभव हुई।

Clinical relevance

उपयुक्त मार्कर का चुनाव यह निर्धारित करता है कि रोगजनकों, उपभेदों या निकट संबंधी जीवों को अलग किया जा सकता है या नहीं, जो आणविक निदान, टाइपिंग और निगरानी के लिए केंद्रीय है।

History

मार्कर का उपयोग एकल संरक्षित जीन जैसे राइबोसोमल आरएनए से, बहु-लोकी डेटासेट के माध्यम से, जीनोम-स्केल फाइलोजेनोमिक्स तक विकसित हुआ; वोज के राइबोसोमल आरएनए तुलनाओं ने जीवन के वृक्ष को फिर से लिखने के लिए एक अच्छी तरह से चुने गए सार्वभौमिक मार्कर की शक्ति का प्रदर्शन किया।

Debates

कुछ अच्छी तरह से चुने गए जीन बनाम जीनोम-स्केल डेटा

फाइलोजेनोमिक्स विशाल वर्ण संख्या प्रदान करता है लेकिन लोकी और व्यवस्थित पूर्वाग्रहों के बीच संघर्ष पैदा करता है, जिससे इस बात पर बहस छिड़ जाती है कि अधिक डेटा या बेहतर-मॉडल वाला डेटा अधिक विश्वसनीय वृक्ष उत्पन्न करता है या नहीं।

Key figures

• Carl Woese
• Joseph Felsenstein

Seminal works

• yang2012
• woese1990
• felsenstein2004

Frequently asked questions

प्राचीन भिन्नताओं के लिए धीरे-धीरे विकसित होने वाले मार्करों का उपयोग क्यों करें?

तेजी से विकसित होने वाले क्षेत्र लंबे समय तक इतने सारे परिवर्तन जमा करते हैं कि संकेत संतृप्त हो जाता है और शोर बन जाता है; धीरे-धीरे विकसित होने वाले मार्कर गहरी समय-सीमाओं में व्याख्या योग्य संकेत बनाए रखते हैं।

फाइलोजेनोमिक्स क्या है?

फाइलोजेनोमिक्स फाइलोजेनी का अनुमान लगाने के लिए जीनोम-स्केल डेटा, सैकड़ों या हजारों लोकी का उपयोग है, जो अधिक वर्ण प्रदान करता है लेकिन मॉडल और हल करने के लिए संघर्ष के अधिक स्रोत भी प्रदान करता है।