डीएनए बारकोडिंग
डीएनए बारकोडिंग ज्ञात प्रजातियों के अनुक्रमों की एक संदर्भ लाइब्रेरी के विरुद्ध एक छोटे, मानकीकृत जीन क्षेत्र की तुलना करके जीवों की पहचान करता है।
Definition
डीएनए बारकोडिंग एक अज्ञात नमूने को एक प्रजाति को असाइन करने के लिए एक या कुछ छोटे मानकीकृत आनुवंशिक मार्करों का उपयोग है, इसके अनुक्रम को एक क्यूरेटेड संदर्भ डेटाबेस से मिलान करके।
Scope
यह विषय डीएनए बारकोडिंग के औचित्य और अभ्यास, जानवरों, पौधों और कवक के लिए उपयोग किए जाने वाले मानक मार्कर क्षेत्रों, संदर्भ लाइब्रेरी के निर्माण और उपयोग, बारकोड गैप अवधारणा, और पहचान के लिए बारकोडिंग की शक्तियों और सीमाओं तथा अवर्णित विविधता को इंगित करने को शामिल करता है।
Core questions
- विभिन्न समूहों के लिए मानक बारकोड के रूप में कौन से जीन क्षेत्र कार्य करते हैं?
- संदर्भ लाइब्रेरी कैसे बनाई और मान्य की जाती हैं?
- बारकोड गैप क्या है और यह क्यों महत्वपूर्ण है?
- बारकोडिंग कहाँ सफल होता है और कहाँ विफल होता है?
Key theories
- मानकीकृत मार्कर पहचान
- एक छोटा मानकीकृत क्षेत्र, जैसे जानवरों में माइटोकॉन्ड्रियल COI जीन, अक्सर अंतर-प्रजाति की तुलना में अंतर-प्रजाति भिन्नता अधिक दिखाता है, जिससे अनुक्रम मिलान द्वारा विश्वसनीय प्रजाति असाइनमेंट सक्षम होता है।
- बारकोड गैप
- पहचान तब सबसे अच्छी तरह से काम करती है जब एक गैप अंतराप्रजातीय से अंतराप्रजातीय आनुवंशिक दूरियों को अलग करता है; अपूर्ण वंशावली छंटनी या संकरण से अतिव्यापी दूरियां स्वच्छ असाइनमेंट को कमजोर करती हैं।
Clinical relevance
बारकोडिंग रोग वाहकों, विनियमित कीटों, खाद्य और औषधीय उत्पाद प्रमाणीकरण की पहचान, और प्रतिस्थापित या गलत लेबल वाली जैविक सामग्री का पता लगाने का समर्थन करता है, जिसमें प्रत्यक्ष सार्वजनिक स्वास्थ्य और व्यापार अनुप्रयोग शामिल हैं।
History
हेबर्ट और सहयोगियों द्वारा 2003 में प्रस्तावित, डीएनए बारकोडिंग समन्वित संदर्भ-लाइब्रेरी परियोजनाओं के माध्यम से तेजी से फैला और बहुत सारे आधुनिक जैव विविधता सर्वेक्षण कार्य को रेखांकित करता है, जिसमें मिश्रित पर्यावरणीय नमूनों का मेटाबारकोडिंग भी शामिल है।
Debates
- पहचान बनाम प्रजाति खोज के रूप में बारकोडिंग
- बारकोडिंग ज्ञात प्रजातियों को नमूनों को असाइन करने के लिए मजबूत है, लेकिन नई प्रजातियों को सीमांकित करने के आधार के रूप में विवादित है, क्योंकि एक एकल मार्कर गुमराह कर सकता है जहां जीन और प्रजाति के इतिहास भिन्न होते हैं।
Key figures
- Paul Hebert
Related topics
Seminal works
- hebert2003
- yang2012
Frequently asked questions
- मानक पशु बारकोड के रूप में किस जीन का उपयोग किया जाता है?
- माइटोकॉन्ड्रियल साइटोक्रोम सी ऑक्सीडेज सबयूनिट I (COI) जीन का एक क्षेत्र जानवरों के लिए मानक बारकोड है; पौधे और कवक विभिन्न मार्करों का उपयोग करते हैं क्योंकि उनमें COI बहुत कम भिन्न होता है।
- क्या डीएनए बारकोडिंग अपने आप नई प्रजातियों का वर्णन कर सकता है?
- यह उम्मीदवार अवर्णित विविधता को इंगित कर सकता है, लेकिन औपचारिक रूप से एक प्रजाति का वर्णन करने के लिए एक एकल बारकोड से परे एकीकृत साक्ष्य की आवश्यकता होती है, क्योंकि एक जीन प्रजाति की सीमाओं को प्रतिबिंबित नहीं कर सकता है।