דלג לתוכןScholarGate
ספרייההספרייה שלישולחןReview Studioעוזר
התחברות
Metagenomic Binning/ראיה
רשומת ראיות למתודה

Metagenomic Binning

Metagenomic binning partitions assembled contigs from complex microbial communities into distinct genome bins, each representing an individual organism or strain. Pioneered by Banfield and colleagues, this pipeline isolates single-organism genomes (metagenome-assembled genomes or MAGs) from environmental samples without requiring cultivated isolates.

Sources recorded, not reviewed

רשומת מקור

ציטוטים הועתקו מילה במילה מרשומת המקור של המתודה. לא מוסקת כל אימות ברמת הטענה מהם.

Metagenome Assembly and Genome Binning
רשומת מתודה טקסונומית · process-pipeline / bioinformatics
  • Kang, D. D., Froula, J., Egan, R., & Wang, Z. (2015). MetaBAT, an efficient tool for accurately reconstructing single genomes from complex microbial communities. PeerJ, 3, e1165. · DOI 10.7717/peerj.1165
  • Jain, C., Rodriguez-R, L. M., Phillippy, A. M., Konstantinidis, K. T., & Aluru, S. (2018). High throughput ANI analysis of 90K prokaryotic genomes reveals clear species boundaries. Nature Communications, 9(1), 4045. · DOI 10.1038/s41467-018-07641-9
  • Sieber, C. M. K., Probst, A. J., Sharrar, A., Thomas, B. C., Hess, M., Tringe, S. G., & Banfield, J. F. (2018). Recovery of genomes from metagenomes via a dereplication, aggregation and scoring strategy. Nature Microbiology, 3(7), 836-843. · DOI 10.1038/s41564-018-0171-1
פתח מתודה מלאה

טענות מאוצרות

טענות שנשמרו ביומן הראיות, לכל אחת הערכה משלה.

עדיין אין טענות מאוצרות

תצוגה זו אינה ממציאה הערכת טענה כאשר ליומן אין אחת.

מתודות קשורות

נוצר מגרף המתודות ומוצג כיחסים שהוצעו על ידי המכונה — לא מוסקת כל טענת ראיה.

Same method familyCRISPR Screen Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Same method familyDe Novo Transcriptome Assemblymachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Same method familyHMMER Profile Searchmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

סטטוס ראיה

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

מקורות

3 ציטוטים מתועדים, הועתקו מרשומת המקור של המתודה.

פעולות

פתח דף מתודה
ScholarGate

ספריית עיון ממוקדת תוכן לשיטות מחקר — מהי כל שיטה, איך היא פועלת ומאין היא באה.

נתונים פתוחים (CC-BY)

גילוי

  • ספרייה
  • חיפוש שיטות…
  • עיון לפי תחום
  • תחומים
  • מסע
  • השוואה
  • איזו שיטה?

עיון

  • תחומים
  • מפה
  • מילון מונחים
  • מתודולוגיה
  • פילוסופיה

סביבת עבודה

  • הספרייה שלי
  • שולחן
  • צ׳אט

חברה

  • אודות
  • תמחור
  • יצירת קשר
  • הצעת שיטה

הערכים מלוקטים ממקורות שפורסמו לצורכי עיון. אימות הדיוק וההתאמה של כל מידע לשימושך שלך נותר באחריותך.

© 2026 ScholarGate · ספריית עיון לשיטות מחקר
  • פרטיות
  • עוגיות
  • תנאי שימוש
  • מחיקת חשבון