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CRISPR Screen Analysis/Preuve
Dossier de preuve de méthode

CRISPR Screen Analysis

CRISPR screen analysis processes data from pooled genetic screens using CRISPR-Cas9 to identify genes required for cell growth, survival, or phenotype in specific conditions. Developed by Zhang, Sanjana, and others, this computational pipeline transforms sequencing readouts of guide RNA abundances into ranked lists of functional genes.

Sources recorded, not reviewed

Dossier source

Citations copiées telles quelles du dossier source de la méthode. Aucune vérification au niveau de la revendication n'en est déduite.

CRISPR Screening Data Analysis and Hit Identification
Dossier de méthode taxonomique · process-pipeline / bioinformatics
  • Shalem, O., Sanjana, N. E., Hartenian, E., Shi, X., Scott, D. A., Mikkelsen, T. S., ... & Zhang, F. (2014). Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Science, 343(6166), 84-87. · DOI 10.1126/science.1247005
  • Hart, T., Chandrashekhar, M., Aregger, M., Steinhart, Z., Brown, K. R., MacLeod, G., ... & Moffat, J. (2015). High-resolution CRISPR screens reveal fitness genes and pathways. Molecular Systems Biology, 11(8), 820. · URL
  • King, J. B., Palmer, A. C., & Sorger, P. K. (2020). Application of a genetic algorithm designed for flexible objective optimization in pharmaceutical research and development. Cancer Research, 79(13 Supplement), 3435. · URL
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Revendications organisées

Revendications enregistrées dans le registre de preuves, chacune avec sa propre évaluation.

Pas encore de revendications organisées

Cette vue n'invente pas d'évaluation de revendication lorsque le registre n'en contient aucune.

Méthodes apparentées

Généré à partir du graphe de méthodes et présenté comme des relations suggérées par la machine — aucune revendication de preuve n'est déduite.

Same method familyDe Novo Transcriptome Assemblymachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Same method familyHMMER Profile Searchmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Same method familyMetagenomic Binningmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

Statut de la preuve

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

Sources

3 citations enregistrées, copiées du dossier source de la méthode.

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