Process / pipelineGenomic variation analysis

LD-lohkoanalyysi

Linkage disequilibrium (LD) -lohkoanalyysi on genominomainen menetelmä, joka jakaa ihmisen genomin erillisiin haplottilohkoihin – alueisiin, joilla rekombinaatio on vähäistä ja variantit ovat vahvassa tilastollisessa assosiaatiossa. Gabriel ja kollegat kuvasivat tämän lähestymistavan ensimmäisen kerran systemaattisesti vuonna 2002. Se paljastaa geneettisen vaihtelun taustalla olevan rakenteen ja mahdollistaa tehokkaat genominomaiset tutkimukset vähentämällä yleisen monimuotoisuuden kattamiseen tarvittavien varianttien määrää. LD-lohkoanalyysi muodostaa perustan genominlaajuisten assosiaatiotutkimusten (GWAS) suunnittelulle ja modernille populaatiogenetiikalle.

Avaa sovelluksessa MethodMindTulossaVideoTulossaDownload slides

Lue koko menetelmä

Vain jäsenille

Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.

Kirjaudu sisään

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

LD-lohkoanalyysi

Sekoittumisanalyysi F-tilastot (FST)IBD-kartoitus Polygeeninen riskipisteet QTL-analyysi GCTA

Lähteet

Gabriel, S. B., Schaffner, S. F., Nguyen, H., Moore, J. M., Roy, J., Blumenstiel, B., & Lander, E. S. (2002). The structure of haplotype blocks in the human genome. Science, 296(5576), 2225–2229. DOI: 10.1126/science.1069424 ↗
Daly, M. J., Rioux, J. D., Schaffner, S. F., Hudson, T. J., & Lander, E. S. (2001). High-resolution haplotype structure in the human genome. Nature Genetics, 29(2), 229–232. DOI: 10.1038/ng1001-229 ↗
Wang, N., Akey, J. M., Zhang, K., Chakraborty, R., & Jin, L. (2005). Distribution of recombination crossovers and the origin of block-like patterns of linkage disequilibrium. Genetics, 155(4), 1599–1606. link ↗

Näin viittaat tähän sivuun

ScholarGate. (2026, June 3). Linkage Disequilibrium Block Analysis and Haplotype Mapping. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/genetics/ld-block-analysis