Hi-C-analyysi
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) on tekniikka ja siihen liittyvät laskennalliset menetelmät genomin 3D-arkkitehtuurin kartoittamiseksi solujen sisällä. Lieberman-Aidenin ja Dekkerin vuonna 2009 kehittämä Hi-C tunnistaa fyysisiä vuorovaikutuksia genomisten alueiden välillä, jotka voivat olla lineaarisessa sekvenssissä etäällä toisistaan mutta spatiaalisesti lähekkäin 3D-tumatilassa. Hi-C-analyysi on paljastanut genomin organisaation perusperiaatteita, mukaan lukien topologisesti assosioituvien domeenien (TAD) olemassaolon, ja antaa tietoa siitä, miten 3D-rakenne säätelee geeniekspressiota ja DNA:n replikaatiota.
Lue koko menetelmä
Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Lähteet
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Näin viittaat tähän sivuun
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/genetics/hi-c-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ATAC-seq-analyysiGenetiikka↔ compare
- RNA-nopeusGenetiikka↔ compare
Tähän viittaavat
Huomasitko virheen tällä sivulla? Ilmoita siitä tai ehdota korjausta →