Yhden solun epigenomilaajuinen assosiaatiotutkimus (scEWAS)
Yhden solun epigenomilaajuinen assosiaatiotutkimus (scEWAS) tutkii epigenettisiä merkkejä – ensisijaisesti DNA-metylaatiota tai kromatiinin saavutettavuutta – koko genomin laajuisesti yhden solun resoluutiolla, ja yhdistää sitten tilastollisesti näiden merkkien vaihtelun fenotyyppiin, sairauteen tai altistukseen. Ratkaisemalla solutyyppien heterogeenisyyden, jota bulkki-EWAS ei pysty erottamaan, scEWAS tunnistaa epigenettiset signaalit, jotka ovat spesifisiä harvinaisille tai sekaisin oleville solupopulaatioille sen sijaan, että ne keskiarvoistettaisiin kudosten yli.
Lue koko menetelmä
Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.
Menetelmäkartta
Lähimenetelmien naapurusto — valitse solmu tutkiaksesi.
Lähteet
- Zhang, Y., et al. (2022). Single-cell epigenome analysis reveals age-associated decay of heterochromatin domains in excitatory neurons in the mouse brain. Cell Research, 32(1), 1-18. link ↗
- Aryee, M. J., et al. (2014). Minfi: a flexible and comprehensive Bioconductor package for the analysis of Infinium DNA methylation microarrays. Bioinformatics, 30(10), 1363-1369. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu049 ↗
Näin viittaat tähän sivuun
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Epigenome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/bioinformatics/single-cell-epigenome-wide-association-study
Mikä menetelmä?
Aseta tämä menetelmä lähimpien sukulaistensa rinnalle ja lue niitä yhdessä — kirjasto asettaa teokset pöydälle; valinta on sinun.
- Epigenomilaajuinen Assosiaatiotutkimus (EWAS)Bioinformatiikka↔ vertaa
Tähän viittaavat
Similar methods
Huomasitko virheen tällä sivulla? Ilmoita siitä tai ehdota korjausta →