فراخوانی قله در چیپ-سیک (ChIP-seq Peak Calling) — فراخوانی قله در تعیین توالی ایمونواینسیپیتاسیون کروماتین
فراخوانی قله در چیپ-سیک یک خط لوله محاسباتی است که نواحی ژنومی را که در آنها پروتئین مورد نظر — یک فاکتور رونویسی یا اصلاح هیستون — بر اساس خوانشهای توالییابی از آزمایشهای ایمونواینسیپیتاسیون کروماتین غنی شده است، شناسایی میکند. این روش دادههای خام توالییابی را به مجموعهای از مکانهای اتصال یا اصلاح با اطمینان بالا در سراسر ژنوم تبدیل میکند و امکان تجزیه و تحلیلهای پاییندستی تنظیم ژن، وضعیت کروماتین و مکانیسمهای اپیژنتیکی را فراهم میآورد.
مطالعهٔ کامل روش
برای خواندن این بخش با حساب رایگان وارد شوید.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
+3 more
منابع
- Zhang, Y., Liu, T., Meyer, C. A., Eeckhoute, J., Johnson, D. S., Bernstein, B. E., Nusbaum, C., Myers, R. M., Brown, M., Li, W., & Liu, X. S. (2008). Model-based analysis of ChIP-seq (MACS). Genome Biology, 9(9), R137. DOI: 10.1186/gb-2008-9-9-r137 ↗
- Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., Bernstein, B. E., Bickel, P., Brown, J. B., Cayting, P., Chen, Y., DeSalvo, G., Epstein, C., Fisher-Aylor, K. I., Euskirchen, G., Gerstein, M., Gertz, J., Hartemink, A. J., Hoffman, M. M., ... Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111 ↗
نحوهٔ استناد به این صفحه
ScholarGate. (2026, June 3). Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/fa/bioinformatics/chip-seq-peak-calling
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- تحلیل ATAC-seqژنتیک↔ compare
- مطالعه انجمنی اپیژِنوم-گسترده (EWAS)زیستاطلاعاتی↔ compare
- تحلیل بیان افتراقی RNA-seqزیستاطلاعاتی↔ compare
- همترازسازی توالیزیستاطلاعاتی↔ compare
- تجزیه و تحلیل توالییابی RNA تکسلولیزیستاطلاعاتی↔ compare
- فراخوانی واریانتزیستاطلاعاتی↔ compare
ارجاعشده در
در این صفحه مشکلی دیدید؟ گزارش دهید یا اصلاحی پیشنهاد کنید →