تحلیل ATAC-seq
ATAC-seq (سنجش کروماتین قابل دسترس با ترانسپوزاز با استفاده از توالییابی) روشی برای تعیین مشخصات چشمانداز دسترسی کروماتین در سراسر ژنوم است. ATAC-seq که توسط بوئنروسترو و همکارانش در سال ۲۰۱۳ توسعه یافت، از ترانسپوزاز بیشفعال برای نشاندار کردن مناطق کروماتین باز و قابل دسترس استفاده میکند و شناسایی سریع و حساس عناصر تنظیمی DNA را ممکن میسازد. ATAC-seq به یک تکنیک استاندارد برای توصیف چشماندازهای تنظیم ژن، کشف عناصر تنظیمی خاص نوع سلول، و استنتاج شبکههای تنظیم ژن تبدیل شده است.
مطالعهٔ کامل روش
برای خواندن این بخش با حساب رایگان وارد شوید.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
منابع
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
نحوهٔ استناد به این صفحه
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/fa/genetics/atac-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
Compare side by side →ارجاعشده در
در این صفحه مشکلی دیدید؟ گزارش دهید یا اصلاحی پیشنهاد کنید →