Meetodi tõendite kirje
Metagenomic Binning
Metagenomic binning partitions assembled contigs from complex microbial communities into distinct genome bins, each representing an individual organism or strain. Pioneered by Banfield and colleagues, this pipeline isolates single-organism genomes (metagenome-assembled genomes or MAGs) from environmental samples without requiring cultivated isolates.
Allikakirje
Tsiteeringud kopeeritud meetodi allikakirjest sõna-sõnalt. Nendest ei saa järeldada väidete tasemel kinnitust.
Metagenome Assembly and Genome Binning
Taksonoomiline meetodikirje · process-pipeline / bioinformatics
- Kang, D. D., Froula, J., Egan, R., & Wang, Z. (2015). MetaBAT, an efficient tool for accurately reconstructing single genomes from complex microbial communities. PeerJ, 3, e1165. · DOI 10.7717/peerj.1165
- Jain, C., Rodriguez-R, L. M., Phillippy, A. M., Konstantinidis, K. T., & Aluru, S. (2018). High throughput ANI analysis of 90K prokaryotic genomes reveals clear species boundaries. Nature Communications, 9(1), 4045. · DOI 10.1038/s41467-018-07641-9
- Sieber, C. M. K., Probst, A. J., Sharrar, A., Thomas, B. C., Hess, M., Tringe, S. G., & Banfield, J. F. (2018). Recovery of genomes from metagenomes via a dereplication, aggregation and scoring strategy. Nature Microbiology, 3(7), 836-843. · DOI 10.1038/s41564-018-0171-1
Kureeritud väited
Väited on salvestatud tõendite registrisse, igal oma hinnanguga.
Kureeritud väiteid veel pole
See vaade ei loo väite hinnangut, kui registris seda pole.
Seotud meetodid
Genereeritud meetodigraafist ja kuvatud masina soovitatud seostena – väiteid ei järeldata.