Código de barras de ADN
El código de barras de ADN identifica organismos comparando una región génica corta y estandarizada con una biblioteca de referencia de secuencias de especies conocidas.
Definition
El código de barras de ADN es el uso de uno o unos pocos marcadores genéticos cortos y estandarizados para asignar un espécimen desconocido a una especie, haciendo coincidir su secuencia con una base de datos de referencia curada.
Scope
Este tema cubre la justificación y la práctica del código de barras de ADN, las regiones marcadoras estándar utilizadas para animales, plantas y hongos, la construcción y el uso de bibliotecas de referencia, el concepto de brecha de código de barras y las fortalezas y limitaciones del código de barras para la identificación y para señalar la diversidad no descrita.
Core questions
- ¿Qué regiones génicas sirven como códigos de barras estándar para diferentes grupos?
- ¿Cómo se construyen y validan las bibliotecas de referencia?
- ¿Qué es la brecha del código de barras y por qué es importante?
- ¿Dónde tiene éxito el código de barras y dónde falla?
Key theories
- Identificación de marcadores estandarizados
- Una región corta estandarizada, como el gen mitocondrial COI en animales, a menudo muestra una mayor variación entre especies que dentro de las especies, lo que permite una asignación fiable de especies mediante la coincidencia de secuencias.
- Brecha del código de barras
- La identificación funciona mejor cuando una brecha separa las distancias genéticas intraespecíficas de las interespecíficas; las distancias superpuestas debidas a la clasificación incompleta del linaje o la hibridación socavan la asignación clara.
Clinical relevance
El código de barras apoya la identificación de vectores de enfermedades, plagas reguladas, la autenticación de productos alimenticios y medicinales, y la detección de materiales biológicos sustituidos o mal etiquetados, con aplicaciones directas para la salud pública y el comercio.
History
Propuesto por Hebert y sus colegas en 2003, el código de barras de ADN se extendió rápidamente a través de proyectos coordinados de bibliotecas de referencia y sustenta gran parte del trabajo moderno de estudio de la biodiversidad, incluida la metabarcodificación de muestras ambientales mixtas.
Debates
- El código de barras como identificación versus descubrimiento de especies
- El código de barras es robusto para asignar especímenes a especies conocidas, pero se cuestiona como base para delimitar nuevas especies, ya que un solo marcador puede inducir a error cuando las historias de los genes y las especies divergen.
Key figures
- Paul Hebert
Related topics
Seminal works
- hebert2003
- yang2012
Frequently asked questions
- ¿Qué gen se utiliza como código de barras animal estándar?
- Una región del gen mitocondrial citocromo c oxidasa subunidad I (COI) es el código de barras estándar para los animales; las plantas y los hongos utilizan diferentes marcadores porque el COI varía muy poco en ellos.
- ¿Puede el código de barras de ADN describir nuevas especies por sí solo?
- Puede señalar la diversidad candidata no descrita, pero la descripción formal de una especie requiere evidencia integradora más allá de un solo código de barras, ya que un gen puede no reflejar los límites de las especies.