Clasificación de Enzimas y Numeración EC

La clasificación de enzimas organiza los miles de enzimas conocidas según las reacciones químicas que catalizan, en lugar de por su estructura u origen. El sistema de numeración de la Comisión de Enzimas (EC) asigna a cada actividad catalítica un número de cuatro partes, proporcionando a biólogos y clínicos una etiqueta única e independiente del idioma para cada enzima caracterizada.

Definition

La numeración EC es una clasificación jerárquica, mantenida por la IUBMB, en la que a cada actividad enzimática se le asigna un número de cuatro partes (p. ej., EC 1.1.1.1) que codifica su clase de reacción, subclase, sub-subclase e identificador de serie.

Scope

Esta entrada abarca el principio de la clasificación basada en reacciones, las siete clases EC de nivel superior y el significado del número EC de cuatro partes, la distinción entre un número EC (una actividad) y un gen o proteína, y los recursos curados que mantienen el sistema. Se trata de un tratamiento de referencia de la nomenclatura enzimática, no de una guía clínica.

Core questions

• ¿Sobre qué base se clasifican las enzimas?
• ¿Qué representan las siete clases EC de nivel superior?
• ¿Qué significa cada uno de los cuatro números en un código EC?
• ¿Por qué un número EC describe una actividad en lugar de una proteína específica?

Key concepts

• Clasificación basada en reacciones
• Número EC de cuatro partes
• Siete clases EC (oxidorreductasas, transferasas, hidrolasas, liasas, isomerasas, ligasas, translocasas)
• Nombres sistemáticos versus recomendados (triviales)
• Actividad versus identidad de gen/proteína
• Recursos de nomenclatura curados (ENZYME, BRENDA)

Mechanisms

Cada enzima se asigna a una de las siete clases de nivel superior según el tipo de reacción que cataliza: oxidorreductasas (clase 1), transferasas (2), hidrolasas (3), liasas (4), isomerasas (5), ligasas (6) y translocasas (7, añadida en 2018). El número EC de cuatro partes luego restringe la descripción jerárquicamente, el primer dígito indica la clase, los dos siguientes la subclase y la sub-subclase (típicamente el enlace o grupo sobre el que actúa), y el cuarto un número de serie para la actividad específica. Dado que el código describe una reacción, un único número EC puede corresponder a varias proteínas o genes distintos, y una proteína puede tener más de un número EC. El sistema es curado y actualizado por la IUBMB y se distribuye a través de recursos como la base de datos ENZYME y BRENDA.

Clinical relevance

Los números EC proporcionan los identificadores estándar utilizados para referirse a las enzimas en bases de datos, descripciones de dianas farmacológicas y mapas de rutas metabólicas, por lo que el sistema subyace a cómo se comparte la información enzimática en biomedicina. Esta entrada explica el marco de nomenclatura y no constituye una base para decisiones de diagnóstico o tratamiento.

Evidence & guidelines

La clasificación se define por las recomendaciones del Comité de Nomenclatura de la IUBMB y se mantiene en bases de datos curadas, incluyendo ENZYME y BRENDA, que sirven como referencia autorizada para las asignaciones EC.

History

Una Comisión Internacional de Enzimas fue convocada a mediados del siglo XX para poner orden en una proliferación de nombres de enzimas inconsistentes, e introdujo el esquema de numeración de cuatro partes basado en reacciones que la IUBMB ha mantenido desde entonces. El sistema fue digitalizado en la base de datos ENZYME (Bairoch, 2000) y complementado por recursos funcionales como BRENDA (Jeske y colaboradores, 2019; Chang y colaboradores, 2021). En 2018 se añadió una séptima clase, las translocasas, para acomodar enzimas que catalizan el movimiento a través de las membranas.

Key figures

• Amos Bairoch
• Dietmar Schomburg

Seminal works

• bairoch-2000
• iubmb-recommendations-2013

Frequently asked questions

¿Qué significan los cuatro números en un código EC?

El primer número indica la clase de reacción general, el segundo y el tercero la restringen a la subclase y sub-subclase (generalmente el enlace o grupo químico involucrado), y el cuarto es un número de serie que identifica la reacción catalizada específica.

¿Un número EC identifica un solo gen o proteína?

No. Un número EC nombra una actividad catalítica, por lo que el mismo número puede aplicarse a varias proteínas no relacionadas, y una proteína puede tener múltiples números EC si cataliza más de una reacción.