Bayesian ChIP-seq Peak Calling — Προσδιορισμός Πιθανοτικής Ενίσχυσης σε Επίτοπα Δεδομένα

Η κλήση κορυφών (peak calling) Bayesian ChIP-seq εφαρμόζει πιθανοτικά μοντέλα — συνήθως Poisson, αρνητικό διωνυμικό ή κρυφά Μαρκοβιανά μοντέλα με Bayesian συμπερασματολογία — για τον εντοπισμό γονιδιωματικών περιοχών με ενίσχυση για μια πρωτεΐνη ενδιαφέροντος σε πειράματα ανοσοκατακρήμνισης χρωματίνης ακολουθούμενα από αλληλουχία (ChIP-seq). Μοντελοποιώντας ρητά τον θόρυβο καταμέτρησης αναγνώσεων και ενσωματώνοντας εκ των προτέρων κατανομές (prior distributions), οι Bayesian καλούντες αποδίδουν εκ των υστέρων πιθανότητες ενίσχυσης (posterior probabilities) αντί για απλές p-τιμές, παρέχοντας ένα αρχές πλαίσιο για την ποσοτικοποίηση της αβεβαιότητας σε ολόκληρο το γονιδίωμα.