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Single-cell RNA-seq analysis/Evidenz
Nachweisdatensatz der Methode

Single-cell RNA-seq analysis

Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) analysis characterises gene expression at the resolution of individual cells, enabling discovery of cell types, states, and transitions that are invisible in bulk transcriptomics. Starting from raw sequencing reads, the workflow produces a cell-by-gene count matrix and proceeds through quality control, normalisation, dimensionality reduction, unsupervised clustering, cell-type annotation, and a range of downstream analyses such as trajectory inference and differential expression between cell populations.

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Quellendatensatz

Zitate wörtlich aus dem Quellendatensatz der Methode übernommen. Daraus wird keine Überprüfung auf Claim-Ebene abgeleitet.

Single-cell RNA Sequencing Analysis
Taxonomischer Methodendatensatz · process-pipeline / bioinformatics
  • Satija, R., Farrell, J. A., Gennert, D., Schier, A. F., & Regev, A. (2015). Spatial reconstruction of single-cell gene expression data. Nature Biotechnology, 33(5), 495–502. · DOI 10.1038/nbt.3192
  • Macosko, E. Z., Basu, A., Satija, R., Nemesh, J., Shekhar, K., Goldman, M., ... & McCarroll, S. A. (2015). Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets. Cell, 161(5), 1202–1214. · DOI 10.1016/j.cell.2015.05.002
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Evidenzstatus

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Quellen

2 aufgezeichnete Zitate, kopiert aus dem Quellendatensatz der Methode.

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