Bayesian Sequence Alignment — Probabilistische Ausrichtung mit Unsicherheitsquantifizierung

Die Bayessche Sequenzausrichtung behandelt die Ausrichtung biologischer Sequenzen (DNA, RNA oder Protein) als ein probabilistisches Inferenzproblem anstatt als eine deterministische Optimierung. Anstatt einer einzelnen besten Ausrichtung werden Stichproben aus einer Posterior-Verteilung über alle plausiblen Ausrichtungen gezogen, gegeben ein Substitutionsmodell und Priors für Gap-Strafen, wodurch die Ausrichtungsunsicherheit quantifiziert wird. Dies ist besonders wertvoll, wenn nachgelagerte Analysen wie phylogenetische Inferenz oder funktionelle Annotation empfindlich auf Ausrichtungsfehler reagieren.