Přejít k obsahuScholarGate
KnihovnaMoje knihovnaStůlReview StudioAsistent
Přihlásit se
Single-cell ChIP-seq peak calling/Důkaz
Záznam důkazů metody

Single-cell ChIP-seq peak calling

Single-cell ChIP-seq peak calling is a bioinformatics pipeline that identifies genomic regions enriched for histone modifications or transcription factor binding in individual cells. By profiling chromatin states at single-cell resolution, it reveals epigenomic heterogeneity hidden in bulk ChIP-seq experiments, enabling researchers to map regulatory landscapes across distinct cell populations within a complex tissue sample.

Sources recorded, not reviewed

Zdrojový záznam

Citace zkopírované doslovně ze zdrojového záznamu metody. Nejsou z nich vyvozovány žádné ověření na úrovni tvrzení.

Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling
Taxonomický záznam metody · process-pipeline / bioinformatics
  • Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. · URL
  • Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. · URL
Otevřít celou metodu

Spravovaná tvrzení

Tvrzení uložená v registru důkazů, každé s vlastním hodnocením.

Zatím žádná spravovaná tvrzení

Tento pohled nevymýšlí hodnocení tvrzení, pokud registr žádné neobsahuje.

Související metody

Vygenerováno z grafu metod a zobrazeno jako strojově navržené vztahy – nejsou z nich vyvozována žádná tvrzení o důkazech.

Taxonomic bucketChIP-seq Peak Callingmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketEpigenome-wide association studymachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell epigenome-wide association studymachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell RNA-seq analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell sequence alignmentmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

Stav důkazů

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

Zdroje

2 zaznamenaných citací, zkopírovaných ze zdrojového záznamu metody.

Akce

Otevřít stránku metody
ScholarGate

Referenční knihovna výzkumných metod, v níž je obsah na prvním místě — co každá metoda je, jak funguje a odkud pochází.

Otevřená data (CC-BY)

Objevovat

  • Knihovna
  • Hledat metody…
  • Procházet podle oborů
  • Obory
  • Cesta
  • Porovnat
  • Která metoda?

Příručka

  • Obory
  • Atlas
  • Slovník pojmů
  • Metodologie
  • Filozofie

Pracovní prostor

  • Moje knihovna
  • Stůl
  • Chat

Společnost

  • O knihovně
  • Ceník
  • Kontakt
  • Navrhnout metodu

Záznamy jsou sestaveny z publikovaných zdrojů a slouží k referenčním účelům. Ověření správnosti a vhodnosti jakékoli informace pro vaše vlastní použití zůstává vaší odpovědností.

© 2026 ScholarGate · Referenční knihovna výzkumných metod
  • Soukromí
  • Soubory cookie
Podmínky
  • Smazat účet