Търсене с HMMER профили
Търсенето с HMMER профили идентифицира далечни хомолози на протеинови последователности, използвайки вероятностни модели на протеинови семейства, известни като профилни Скрити Марковски Модели (HMMs). Разработен от Еди и колеги, този метод улавя моделите на вариация в последователностите в рамките на протеиновите семейства и открива хомолози със значително по-голяма чувствителност от матриците на позиционните тегла или двустранните подравнявания.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
Източници
- Krogh, A., Brown, M., Mian, I. S., Sjölander, K., & Haussler, D. (1994). Hidden Markov models in computational biology: applications to protein modeling. Journal of Molecular Biology, 235(5), 1501-1531. DOI: 10.1006/jmbi.1994.1104 ↗
- Eddy, S. R. (1998). Profile hidden Markov models. Bioinformatics, 14(9), 755-763. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.9.755 ↗
- Finn, R. D., Clements, J., & Eddy, S. R. (2011). HMMER web server: interactive sequence similarity searching. Nucleic Acids Research, 39(Web Server issue), W29-W37. DOI: 10.1093/nar/gkr367 ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Hidden Markov Model Profile Search for Sequence Homology. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/bioinformatics/hmmer-profile-search
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- Реконструкция чрез крио-ЕМБиоинформатика↔ сравняване
- Метагеномно биниранеБиоинформатика↔ сравняване
- Молекулярно докиранеБиоинформатика↔ сравняване
Цитиран в
Similar methods
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →