التشخيص المخبري وتقنيات الزرع
التشخيص المخبري وتقنيات الزرع هي الأساليب التي يستخدمها مختبر الأحياء الدقيقة السريرية للكشف عن البكتيريا المسؤولة عن العدوى وتنميتها وتحديد هويتها. يوجه هذا المجال القارئ عبر المسار التشخيصي الكامل، بدءًا من كيفية جمع العينة ونقلها إلى كيفية زرع الكائن الحي وتسميته وتأكيده بالوسائل المظهرية أو الجزيئية، بالإضافة إلى أنظمة الجودة التي تجعل هذه النتائج موثوقة.
Definition
يشمل التشخيص المخبري وتقنيات الزرع الأساليب التحليلية وما قبل التحليلية المستخدمة في علم الجراثيم السريري لاستعادة مسببات الأمراض البكتيرية من العينات السريرية وتحديد هويتها وتوصيفها، بما في ذلك الزرع، التحديد المظهري، الكشف الجزيئي، وضمان الجودة.
Scope
يستعرض هذا المجال مكونات التشخيص البكتيري كسير عمل متصل: الاختيار المناسب للعينة ومعالجتها، أوساط الزرع وظروف الحضانة التي تستعيد الكائنات الحية، التحديد المظهري والتحديد القائم على مطيافية الكتلة، تضخيم الحمض النووي والتشخيصات الجزيئية الأخرى، ومراقبة جودة المختبر. ويؤطر هذه المفاهيم كمفاهيم مرجعية لفهم كيفية توليد الأدلة المخبرية، وليس كدليل لطلب أو تفسير الاختبارات في مريض فردي.
Sub-topics
Core questions
- كيف يستعيد المختبر مسببات الأمراض البكتيرية من عينة سريرية؟
- ما الذي يحدد ما إذا كان الكائن الحي المزروع ممرضًا أم مستعمرًا أم ملوثًا؟
- كيف يتم تحديد البكتيريا بمجرد استعادتها، وما هي الطرق الأحدث التي تكمل أو تحل محل الزرع؟
- ما هي أنظمة الجودة التي تضمن دقة وموثوقية نتائج علم الأحياء الدقيقة؟
Key concepts
- المراحل ما قبل التحليلية والتحليلية وما بعد التحليلية
- أوساط الزرع وظروف الحضانة
- التحديد المظهري
- مطيافية الكتلة MALDI-TOF (Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight)
- اختبار تضخيم الحمض النووي
- جودة العينة والتلوث
- مراقبة جودة المختبر واختبار الكفاءة
Mechanisms
يتقدم التشخيص البكتيري وفق سير عمل تعتمد صلاحيته على كل خطوة. يتم جمع عينة ممثلة لموقع العدوى ونقلها في ظروف تحافظ على الكائنات الحية القابلة للحياة، ثم تلقيحها على أوساط وحضانتها في أجواء مناسبة لمسببات الأمراض المشتبه بها. يتم فحص النمو وتحديد العزلات عن طريق التفاعلات المظهرية أو، بشكل متزايد، عن طريق مطيافية الكتلة MALDI-TOF؛ ويمكن للطرق الجزيئية الكشف عن الكائنات الحية مباشرة من العينات دون زرع مسبق. طوال العملية، تتحقق إجراءات مراقبة الجودة من أن الأوساط والكواشف والأجهزة تعمل كما هو متوقع، بحيث تعكس النتيجة المبلغ عنها حالة المريض بدلاً من أن تكون ناتجة عن خطأ مخبري. توضح الإرشادات الموثوقة أن المختبر والطبيب شريكان تحدد قراراتهما المشتركة حول ما يجب جمعه واختباره العائد التشخيصي (Baron 2013).
Clinical relevance
تدعم النتائج التي تنتجها هذه الأساليب الكثير من الأدلة المستخدمة لنسب العدوى إلى كائنات حية محددة وتتبع المقاومة. يساعد فهم المسار التشخيصي القراء على تقييم سبب سلبية الزرع على الرغم من وجود العدوى، وسبب أن الزرع الإيجابي قد يمثل تلوثًا، وكيف تغير الأدوات الجزيئية والبروتينية الأحدث وقت الاستجابة التشخيصية. يصف هذا المجال كيفية توليد الأدلة المخبرية وليس أساسًا لقرارات التشخيص أو العلاج الفردية.
Evidence & guidelines
تصف الإرشادات المتفق عليها من جمعية الأمراض المعدية الأمريكية والجمعية الأمريكية لعلم الأحياء الدقيقة الاختيار المناسب للعينات واستخدام المختبر لتشخيص الأمراض المعدية (Baron 2013). وتصنف النصوص المرجعية مثل دليل علم الأحياء الدقيقة السريري (Manual of Clinical Microbiology) طرق الزرع والتحديد القياسية (Jorgensen 2015)، وقد تتبعت المراجعات التحول نحو التشخيصات الجزيئية والبروتينية الأسرع (Caliendo 2013).
History
تطور علم الجراثيم التشخيصي من طرق الزرع في أواخر القرن التاسع عشر التي استخدمها علماء الأحياء الدقيقة الأوائل ونضج خلال القرن العشرين ليصبح مخططات مظهرية موحدة. جلبت أواخر القرن العشرين وأوائل القرن الحادي والعشرين تضخيم الحمض النووي ومطيافية الكتلة MALDI-TOF، مما قلل من أوقات التحديد، وفي بعض الأحيان، سمح بالكشف دون زرع (Caliendo 2013).
Related topics
Seminal works
- baron-2013
- jorgensen-2015
- caliendo-2013
Frequently asked questions
- ماذا يفعل مختبر الأحياء الدقيقة السريرية بالفعل؟
- يستعيد الكائنات الدقيقة من العينات السريرية ويحدد هويتها ويوصفها، باستخدام الزرع، والتحديد المظهري والجزيئي، وأنظمة الجودة بحيث تعكس النتائج بشكل موثوق ما هو موجود في المريض.
- هل لا يزال الزرع ضروريًا الآن بعد وجود الاختبارات الجزيئية؟
- يبقى الزرع محوريًا لأنه يستعيد عزلة قابلة للحياة لمزيد من الاختبارات، لكن الطرق الجزيئية ومطيافية الكتلة تكمله بشكل متزايد عن طريق تسريع التحديد، وبالنسبة لبعض الأهداف، الكشف عن الكائنات الحية مباشرة من العينات.