ScholarGate
Асистент
Process / pipelineBioinformatics / omics

Часовий виклик варіантів — поздовжнє виявлення соматичних мутацій

Часовий виклик варіантів — це біоінформатичний конвеєр, який ідентифікує та відстежує геномні варіанти — зазвичай соматичні мутації — у множинних послідовних зразках, зібраних від одного суб'єкта в різні моменти часу. Він найширше застосовується в онкогеноміці для реконструкції еволюції пухлини, моніторингу мінімальної залишкової хвороби та виявлення появи клонів, стійких до терапії. Спільне моделювання частот алелів варіантів у часовому вимірі дозволяє відрізнити справжні соматичні зміни від шуму секвенування та оцінити динаміку клонів з часом.

Відкрити у MethodMindНезабаромВідеоНезабаромЗавантажити слайди

Читати метод повністю

Лише для учасників

Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.

Увійти

Карта методів

Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.

Часовий виклик варіантів
Аналіз диференційної екс…

Джерела

  1. Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. link
  2. McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. link

Як цитувати цю сторінку

ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/time-series-variant-calling

Який метод?

Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.

Порівняти поруч
ScholarGateTime-series variant calling (Time-series Variant Calling). Отримано 2026-06-15 з https://scholargate.app/uk/bioinformatics/time-series-variant-calling · Набір даних: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026