การทดสอบ HKA
การทดสอบ Hudson-Kreitman-Aguade (HKA) เป็นวิธีการทางสถิติที่ทดสอบวิวัฒนาการแบบเป็นกลาง (neutral evolution) โดยการเปรียบเทียบระดับความหลากหลายภายในประชากร (within-population polymorphism) และความแตกต่างระหว่างประชากร (between-population divergence) ที่ตำแหน่งจีโนมหลายตำแหน่ง การทดสอบนี้พัฒนาขึ้นโดย Hudson, Kreitman และ Aguade ในปี 1987 โดยใช้หลักการที่ว่าตำแหน่งจีโนมที่เป็นกลางควรแสดงความสัมพันธ์ที่คาดการณ์ไว้ระหว่างความหลากหลายและความแตกต่าง ตำแหน่งจีโนมที่เบี่ยงเบนจากความสัมพันธ์เหล่านี้ถือเป็นตัวเลือกที่อาจอยู่ภายใต้แรงคัดเลือก การทดสอบ HKA มีประโยชน์อย่างยิ่งในการตรวจจับแรงคัดเลือกในการสำรวจทั่วทั้งจีโนม (genome-wide surveys) เนื่องจากใช้การเปรียบเทียบเชิงสัมพัทธ์ระหว่างตำแหน่งจีโนมต่างๆ แทนที่จะต้องมีการปรับเทียบภายนอก
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
แหล่งอ้างอิง
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/th/genetics/hka-test
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ทฤษฎีการรวมตัว (Coalescent Theory)พันธุศาสตร์↔ compare
- F-statistics (FST)พันธุศาสตร์↔ compare
- การทดสอบแมคโดนัลด์-เครตแมนพันธุศาสตร์↔ compare
- การทดสอบการกวาดล้างโดยการคัดเลือก (Tajima's D)พันธุศาสตร์↔ compare