ScholarGate
ผู้ช่วย
Process / pipelineBioinformatics / omics

การระบุความแปรผันแบบอนุกรมเวลา — การตรวจจับการกลายพันธุ์ทางกายภาพแบบตามยาว

การระบุความแปรผันแบบอนุกรมเวลา (Time-series variant calling) เป็นไปป์ไลน์ชีวสารสนเทศที่ระบุและติดตามความแปรผันทางจีโนม ซึ่งโดยทั่วไปคือการกลายพันธุ์ทางกายภาพ (somatic mutations) ในตัวอย่างการจัดลำดับหลายชุดที่เก็บจากบุคคลเดียวกัน ณ จุดเวลาต่างกัน วิธีนี้ใช้กันอย่างแพร่หลายที่สุดในจีโนมิกส์มะเร็งเพื่อสร้างวิวัฒนาการของเนื้องอก ติดตามโรคที่หลงเหลืออยู่น้อยที่สุด (minimal residual disease) และตรวจจับการเกิดขึ้นของโคลนที่ดื้อต่อการรักษา ด้วยการสร้างแบบจำลองความถี่อัลลีลของความแปรผันร่วมกันตลอดมิติเวลา วิธีนี้จะแยกความแตกต่างระหว่างการเปลี่ยนแปลงทางกายภาพที่แท้จริงออกจากสัญญาณรบกวนจากการจัดลำดับ และประมาณการพลวัตของโคลนเมื่อเวลาผ่านไป

เปิดใน MethodMindเร็ว ๆ นี้วิดีโอเร็ว ๆ นี้ดาวน์โหลดสไลด์

อ่านวิธีฉบับเต็ม

สำหรับสมาชิกเท่านั้น

เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้

เข้าสู่ระบบ

แผนที่ระเบียบวิธี

ย่านของระเบียบวิธีที่เกี่ยวข้องกัน — เลือกโหนดเพื่อสำรวจ

การระบุความแปรผันแบบอนุกรมเวลา
การแสดงออกแตกต่างกันของ…

แหล่งอ้างอิง

  1. Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. link
  2. McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. link

วิธีอ้างอิงหน้านี้

ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/time-series-variant-calling

ระเบียบวิธีใด?

วางระเบียบวิธีนี้เคียงข้างระเบียบวิธีใกล้เคียงที่สุด แล้วอ่านเปรียบเทียบกัน — คลังวางหนังสือไว้บนโต๊ะให้แล้ว ส่วนการเลือกเป็นของท่าน

เปรียบเทียบเคียงข้างกัน
ScholarGateTime-series variant calling (Time-series Variant Calling). สืบค้นเมื่อ 2026-06-15 จาก https://scholargate.app/th/bioinformatics/time-series-variant-calling · ชุดข้อมูล: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026