Analiza Filogjenetike e Bazuar në Rrjet — Inferenca e Rrjetit Filogjenetik

Analiza filogjenetike e bazuar në rrjet ndërton përfaqësime të strukturuara si graf të marrëdhënieve evolutive që akomodojnë në mënyrë eksplicite ngjarje retikulare — duke përfshirë hibridizimin, transferimin horizontal të gjeneve, rekombinimin dhe klasifikimin e paplotë të linjave — të cilat pemët filogjenetike që ndahen në mënyrë rigoroze nuk mund t'i përfaqësojnë. Në vend që të detyrojë sekuencat në një pemë të vetme bifurkuese, metoda inferon ndarje ose retikulime në të dhëna dhe i vizualizon ato si një rrjet, duke zbuluar sinjale filogjenetike konfliktuale që janë informuese biologjikisht.