Test HKA
Test Hudson-Kreitman-Aguade (HKA) je štatistická metóda, ktorá testuje neutrálny vývoj porovnávaním úrovní polymorfizmu v rámci populácie a divergencie medzi populáciami na viacerých lokusoch. Test, vyvinutý Hudsonom, Kreitmanom a Aguadeom v roku 1987, využíva princíp, že neutrálne lokusy by mali vykazovať očakávané vzťahy medzi polymorfizmom a divergenciou. Lokusy, ktoré sa od týchto vzťahov odchýlia, sú kandidátmi na selekciu. Test HKA je obzvlášť užitočný pri detekcii selekcie v celogenómových prieskumoch, pretože používa relatívne porovnania naprieč lokusmi namiesto vyžadovania externej kalibrácie.
Prečítať celú metódu
Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.
Mapa metód
Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.
Zdroje
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
Ako citovať túto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/genetics/hka-test
Ktorá metóda?
Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.
- Koalescenčná teóriaGenetika↔ porovnať
- F-štatistiky (FST)Genetika↔ porovnať
- McDonald-Kreitmanov testGenetika↔ porovnať
- Selection Sweep (Tajima's D)Genetika↔ porovnať
Odkazujú sem
Našli ste na tejto stránke chybu? Nahláste ju alebo navrhnite opravu →