ScholarGate
Asistent
Process / pipeline3D genomics

Analýza Hi-C

Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) je technika a súvisiace výpočtové metódy na mapovanie 3D architektúry genómu v bunkách. Hi-C, vyvinuté Lieberman- Aidenom a Dekkerom v roku 2009, identifikuje fyzikálne interakcie medzi genómovými oblasťami, ktoré môžu byť vzdialené v lineárnom poradí, ale priestorovo blízke v 3D jadrovom priestore. Analýza Hi-C odhalila základné princípy organizácie genómu, vrátane existencie topologicky asociovaných domén (TAD), a poskytuje vhľad do toho, ako 3D štruktúra reguluje expresiu génov a replikáciu DNA.

Otvoriť v MethodMindČoskoroVideoČoskoroDownload slides

Prečítať celú metódu

Len pre členov

Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.

Prihlásiť sa

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Zdroje

  1. Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369
  2. Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082
  3. Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link

Ako citovať túto stránku

ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/genetics/hi-c-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side

Odkazujú sem

ScholarGateHi-C Analysis (Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions). Získané 2026-06-15 z https://scholargate.app/sk/genetics/hi-c-analysis · Dátová sada: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026