ScholarGate
Asistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Volanie variantov časových radov — longitudinálna detekcia somatických mutácií

Volanie variantov časových radov je bioinformatický pipeline, ktorý identifikuje a sleduje genómové varianty — typicky somatické mutácie — naprieč viacerými sekvenačnými vzorkami získanými od toho istého jedinca v rôznych časových bodoch. Najčastejšie sa používa v onkologickej genóme na rekonštrukciu evolúcie nádoru, monitorovanie minimálnej reziduálnej choroby a detekciu vzniku klonov rezistentných voči terapii. Spoločným modelovaním frekvencií alel variantov naprieč časovou dimenziou táto metóda rozlišuje skutočné somatické zmeny od sekvenačného šumu a odhaduje klonálnu dynamiku v priebehu času.

Otvoriť v MethodMindČoskoroVideoČoskoroStiahnuť snímky

Prečítať celú metódu

Len pre členov

Ak si chcete prečítať túto sekciu, prihláste sa s bezplatným účtom.

Prihlásiť sa

Mapa metód

Okolie príbuzných metód — vyberte uzol na preskúmanie.

Volanie variantov časových radov
Analýza diferenciálnej e…

Zdroje

  1. Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. link
  2. McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. link

Ako citovať túto stránku

ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/sk/bioinformatics/time-series-variant-calling

Ktorá metóda?

Postavte túto metódu vedľa jej najbližších príbuzných a čítajte ich vedľa seba — knižnica vám knihy položí na stôl; voľba je na vás.

Porovnať vedľa seba
ScholarGateTime-series variant calling (Time-series Variant Calling). Získané 2026-06-15 z https://scholargate.app/sk/bioinformatics/time-series-variant-calling · Dátová sada: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026