Анализ Hi-C
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture — захват конформации хромосом в высоком разрешении) — это метод и связанные с ним вычислительные подходы для картирования 3D-архитектуры генома в клетках. Разработанный Либерманом-Айденом и Деккером в 2009 году, Hi-C идентифицирует физические взаимодействия между геномными областями, которые могут быть удалены по линейной последовательности, но пространственно близки в 3D-пространстве ядра. Анализ Hi-C выявил фундаментальные принципы организации генома, включая существование топологически ассоциированных доменов (TAD), и дает представление о том, как 3D-структура регулирует экспрессию генов и репликацию ДНК.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Источники
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/genetics/hi-c-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Анализ ATAC-seqГенетика↔ compare
- РНК-скоростьГенетика↔ compare
Упоминается в
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →