Alinierea secvențelor de celulă unică — Maparea citirilor scRNA-seq
Alinierea secvențelor de celulă unică este pasul computațional care mapează milioanele de citiri scurte de secvențiere produse de experimentele de ARN-seq de celulă unică înapoi la un genom sau transcriptom de referință. Spre deosebire de alinierea ARN-seq în vrac, fiecare citire poartă un cod de bare celular și un identificator molecular unic (UMI) care, împreună, identifică celula de origine și molecula individuală de ARN. Alinierea precisă și demultiplexarea codurilor de bare sunt precondiții pentru construirea matricei de numărare celulă-genă care conduce toate analizele ulterioare de celulă unică.
Citește metoda completă
Autentifică-te cu un cont gratuit pentru a citi această secțiune.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Surse
- Dobin, A., Davis, C. A., Schlesinger, F., Drenkow, J., Zaleski, C., Jha, S., Batut, P., Chaisson, M., & Gingeras, T. R. (2013). STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner. Bioinformatics, 29(1), 15–21. DOI: 10.1093/bioinformatics/bts635 ↗
- Smith, T., Heger, A., & Sudbery, I. (2017). UMI-tools: modeling sequencing errors in Unique Molecular Identifiers to improve quantification accuracy. Genome Research, 27(3), 491–499. DOI: 10.1101/gr.209601.116 ↗
Cum se citează această pagină
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA-seq Sequence Alignment. ScholarGate. https://scholargate.app/ro/bioinformatics/single-cell-sequence-alignment
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Expresia Diferențială RNA-seqBioinformatică↔ compare
Citat de
Ai observat o problemă pe această pagină? Raportează sau sugerează o corectură →