Process / pipelineBioinformatics / omics

Analiza de îmbogățire a căilor bazată pe rețea

Analiza de îmbogățire a căilor bazată pe rețea integrează rețele de interacțiune moleculară — interacțiuni proteină-proteină, grafuri de semnalizare sau rețele de reglare genică — cu măsurători omice pentru a identifica căi biologice care sunt alterate coordonat într-o anumită condiție. Spre deosebire de abordările clasice de supra-reprezentare sau de îmbogățire a seturilor de gene, care tratează genele din căi ca liste independente, această familie de metode propagă semnale de-a lungul legăturilor rețelei, captând topologia interacțiunilor și descoperind module dereglate pe care îmbogățirea pe liste plate le-ar omite.

Deschide în MethodMindÎn curândVideoÎn curândDownload slides

Citește metoda completă

Doar pentru membri

Autentifică-te cu un cont gratuit pentru a citi această secțiune.

Autentificare

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Surse

  1. Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link
  2. Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182

Cum se citează această pagină

ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ro/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side

Citat de

ScholarGateNetwork-based pathway enrichment analysis (Network-based Pathway Enrichment Analysis). Preluat la 2026-06-15 de pe https://scholargate.app/ro/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis · Set de date: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026